Theo Bộ Tài chính, qua quá trình nghiên cứu, tìm hiểu liên quan đến hàng hóa gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh và thương mại điện tử, được biết thời gian gần đây một số quốc gia bắt đầu nghiên cứu và thực hiện việc thu thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng hóa có trị giá thấp như tại EU từ 1/7/2021 thực hiện thu thuế GTGT đối với các lô hàng từ 22 euro trở xuống (trước đây các lô hàng này được miễn thuế GTGT), tại Singapore từ 01/01/2023 bãi bỏ quy định miễn thuế GTGT đối với hàng hóa trị giá thấp.

Ngoài ra, tại các cuộc hội thảo, chuyên gia dự án tạo thuận lợi thương mại (TFP) cũng khuyến cáo Việt Nam cân nhắc quy định không phải nộp thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu trị giá thấp.

Do đó, Tổng cục Hải quan đã trình Bộ Tài chính trình Chính phủ đề nghị bãi bỏ Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg tại dự thảo Nghị định quy định về quản lý hải quan đối với hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu giao dịch qua thương mại điện tử.

Hiện nay, dự thảo Nghị định về quản lý hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu giao dịch qua thương mại điện tử đã được Bộ Tài chính hoàn thiện dự thảo sau khi tiếp thu ý kiến Thành viên Chính phủ báo cáo Phó Thủ tướng Chính phủ Lê Minh Khái, Thủ tướng Chính phủ tại Công văn số 6289/BTC-TCHQ ngày 20/6/2023.

Ngày 26/7/2023, Văn phòng Chính phủ đã có Văn bản số 5657/VPCP-KTTH gửi Bộ Tài Chính truyền đạt chỉ đạo ý kiến của Phó Thủ tướng Chính phủ Lê Minh Khái như sau: “Bộ Tài chính khẩn trương triển khai thực hiện dự án “Xây dựng hệ thống công nghệ thông tin thực hiện hải quan số đáp ứng yêu cầu nghiệp vụ trong thông quan”, trên cơ sở đó tiếp tục nghiên cứu, hoàn thiện dự thảo Nghị định về quản lý hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu giao dịch qua thương mại điện tử, đảm bảo tính khả thi, đồng bộ với việc hoàn thành hệ thống công nghệ thông tin theo dự án trên, trình Chính phủ xem xét, quyết định trong quý 4 năm 2024…”.

Thực hiện ý kiến chỉ đạo của Phó Thủ tướng Chính phủ Lê Minh Khái, quý 4 năm 2024, Tổng cục Hải quan sẽ báo cáo Bộ Tài chính trình Chính phủ ban hành Nghị định. Tuy nhiên, việc ban hành Nghị định còn phụ thuộc tiến độ đầu tư Hệ thống hải quan số.

Vì vậy, để thực hiện thu thuế GTGT đối với hàng hóa bưu chính, chuyển phát nhanh theo đúng quy định của Luật thuế GTGT, tiếp theo các công văn số 99/TXNK-CST ngày 25/4/2024, số 116/TXNK-CST ngày 09/5/2024, số 708/TXNK-CST ngày 14/6/2024, Tổng cục Hải quan tiếp tục có công văn số 167/TXNK-CST ngày 10/7/2024 đề nghị Cục QLGSCS thuế, phí, lệ phí (là đơn vị chủ trì xây dựng Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg) báo cáo Bộ Tài chính trình Thủ tướng Chính phủ xem xét bãi bỏ Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg mà không chờ vào tiến độ của Nghị định về quản lý hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu giao dịch qua thương mại điện tử.

Đồng thời, Tổng cục Hải quan cũng đề nghị Cục Quản lý giám sát chính sách thuế, phí và lệ phí xin ý kiến các cơ quan có thẩm quyền về thực hiện điều ước quốc tế (như Bộ Tư pháp, Bộ Ngoại giao) đối với trách nhiệm của Việt Nam khi thực hiện Công ước Kyoto về không thu thuế hải quan và thuế khác đối với hàng hóa có trị giá tối thiểu và/hoặc số thuế hải quan và thuế khác tối thiểu trong trường hợp bãi bỏ Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg.